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本文着眼于现代大学制度下我国内部治理结构的研究，在综合分析了发达国家大学的内部治理情况的基础上结合我国自身特点对我国研究型大学的内部治理结构的构建进行了探讨，并提出了参考性质的大学内部治理结构图。 现代大学制度是关于大学管理与运行的规则体系，是以大学的学术性本质为根据的，确定大学存在与发展的规则体系。按照组织层次进行划分，大学制度主要可以分为政府管理制度、社会参与制度、大学治理制度。其中大学的内部治理结构主要是指大学内部的主要的管理权力机构的结合情况。我国大学内部治理的特色在于除了学术权力和行政权力还包括以党委为领导的政治权力。如何处理好这三方面的关系成了搞好我国大学内部治理的关键问题。我国大学目前的内部治理模式是典型的集权模式，其主要的弊病在于党政不分、学术权力地位低微。本文针对这种情况对高校内部治理结构改革进行了一系列分析，提出了从思想转变到制度保障的阶段性思路，并尝试构建了大学内部治理的结构图，希望对我国大学内部治理改革起到积极的借鉴作用。